La Cruz de Huanacaxtle está localizada en el Estado de Nayarit, en la parte norte de Bahía de Banderas. Geográficamente esta protegida por una ensenada lo cual la convierte en una zona privilegiada.

La Bahía de Banderas se encuentra en una franja angosta en el Océano Pacífico limitando en el Este con los Estados de Sonora, Sinaloa, Nayarit y Jalisco.

Específicamente la Bahía de Banderas está localizada entre los paralelos 20 24' y 20 45' Norte y entre los meridianos 105 14 y 105 42' Oeste. Al Sur limita con Cabo Corrientes y al Norte con Punta de Mita. Su costa recae en dos Estados; Nayarit al Norte y Jalisco al Sur. La parte de Nayarit se estrecha desde la parte del Río Ameca en la parte central de la Bahía hacia el Norte de Punta de Mita, y con la parte del Estado de Jalisco alcanzando desde el Río Ameca al sur de Cabo Corrientes.

Los municipios mas importantes son Puerto Vallarta en el Estado de Jalisco y Bahía de Banderas en el Estado de Nayarit, los cuales ofrecen un sin fín de actividades acuáticas.